Khác với các biến thể màu sắc và hình dạng một chút, những trường hợp dưới đây là những cá thể Pokémon hiếm gặp ngoài tự nhiên:
- Kiểu lông khác so với thông thường.

Pikachu
Lông của Pikachu có thể khác biệt tùy theo từng cá thể.

Eevee
Lông của Eevee có thể khác biệt tùy theo từng cá thể.

Furfrou
Bên cạnh các kiểu lông chính thức, Furfrou cũng có thể được tạo kiểu theo sở thích riêng của Huấn luyện viên [Trainer].

Sandy
Một Eevee với biệt danh Sandy, thuộc sở hữu của Lana.

Sparky
Một Pikachu với biệt danh Sparky thuộc sở hữu của Ritchie.
- Hoa văn khác so với thông thường.

Arbok họa tiết tốc độ
Arbok có thể linh hoạt thay đổi họa tiết trên mang vào bất kỳ lúc nào, nhằm gia tăng sức Tấn Công [Attack], Tốc Độ [Speed] hoặc trở nên miễn nhiễm với các Trạng Thái Bất Thường [Status Condition].

Arbok họa tiết tấn công
Arbok có thể linh hoạt thay đổi họa tiết trên mang vào bất kỳ lúc nào, nhằm gia tăng sức Tấn Công [Attack], Tốc Độ [Speed] hoặc trở nên miễn nhiễm với các Trạng Thái Bất Thường [Status Condition].

Arbok họa tiết miễn nhiễm
Arbok có thể linh hoạt thay đổi họa tiết trên mang vào bất kỳ lúc nào, nhằm gia tăng sức Tấn Công [Attack], Tốc Độ [Speed] hoặc trở nên miễn nhiễm với các Trạng Thái Bất Thường [Status Condition].

Biến thể Spinda
Người ta tin rằng không có hai Spinda nào sở hữu hoa văn giống hệt nhau.

Spinda hoa văn trái tim
Một Spinda có hoa văn trái tim hiếm gặp.

Wooper hoa văn trái tim
Một Wooper có hoa văn trái tim hiếm gặp.

Bulbasaur hoa văn trái tim
Một Bulbasaur có hoa văn trái tim hiếm gặp.
- Số lượng cá thể ít hoặc nhiều hơn so với thông thường.

Exeggutor 4 đầu
Nếu sống trong môi trường thuận lợi, Exeggutor có thể mọc thêm nhiều đầu. Một số đầu sau đó sẽ rụng xuống (đôi khi bị vỡ) và trở thành những cá thể Exeggcute đơn lẻ. Các Exeggcute này rồi sẽ tập hợp thành nhóm sáu con hoàn chỉnh của loài Exeggcute.

Exeggutor 5 đầu
Nếu sống trong môi trường thuận lợi, Exeggutor có thể mọc thêm nhiều đầu. Một số đầu sau đó sẽ rụng xuống (đôi khi bị vỡ) và trở thành những cá thể Exeggcute đơn lẻ. Các Exeggcute này rồi sẽ tập hợp thành nhóm sáu con hoàn chỉnh của loài Exeggcute.

Exeggcute đơn lẻ
Nếu sống trong môi trường thuận lợi, Exeggutor có thể mọc thêm nhiều đầu. Một số đầu sau đó sẽ rụng xuống (đôi khi bị vỡ) và trở thành những cá thể Exeggcute đơn lẻ. Các Exeggcute này rồi sẽ tập hợp thành nhóm sáu con hoàn chỉnh của loài Exeggcute.

Binacle đơn lẻ
Binacle là hai cá thể sống chung trong một tảng đá và cần hợp tác để tồn tại. Khi xảy ra mâu thuẫn, một trong số chúng sẽ rời đi để tìm một tảng đá khác có Binacle đơn lẻ đang chờ ghép cặp.

Falinks thủ lĩnh
Falinks là một nhóm gồm sáu cá thể đơn lẻ, trong đó một con lớn nhất đóng vai trò thủ lĩnh, còn năm con còn lại tuyệt đối tuân theo mệnh lệnh của nó.

Kangaskhan con
Kangaskhan luôn xuất hiện dưới hình thức một cặp mẹ con, ngay cả khi nở ra từ trứng. Khi cảm thấy môi trường xung quanh an toàn, Kangaskhan mẹ sẽ cho phép con ra khỏi túi để chơi đùa.
- Bị mất hoặc thêm một bộ phận nào đó.

Meowth thụt đồng xu
Một tai nạn hi hữu khiến đồng xu trên đầu Meowth bị thụt sâu vào trong.

Spoink mất ngọc
Viên ngọc trên đầu Spoink chính là viên ngọc trai mà Clamperl tạo ra. Viên ngọc này giúp Spoink khuếch đại sức mạnh siêu linh của nó. Vì vậy, nó sẽ yếu đi nếu viên ngọc trên đầu bị mất.

Clamperl ngọc hồng
Viên ngọc trai do Clamperl tạo ra có khả năng khuếch đại sức mạnh tâm linh của Spoink khi Spoink đội viên ngọc trên đầu.

Clamperl ngọc lam
Đôi khi, Clamperl còn tạo ra những viên ngọc trai hiếm có màu lam vì một lý do chưa rõ.

Pangoro mất lá
Khi Pangoro mất chiếc lá trúc mà nó thường ngậm trong miệng, nó sẽ trở nên nhút nhát và thiếu tự tin.

Golem mất ria mép
Khi Alolan Golem mất đi ria mép cát sắt ở mặt, chúng sẽ trở nên nhút nhát và thiếu tự tin.

Yamask mất mặt nạ
Yamask luôn ôm chiếc mặt nạ như một ký ức còn sót lại từ kiếp người. Mỗi khi chiếc mặt nạ ấy bị mất hoặc bị lấy đi, Yamask sẽ nổi giận dữ dội.

Meltan mất đai ốc
Khi chẳng may làm rơi chiếc đai ốc trên đầu, Meltan sẽ không ngừng tìm kiếm những vật thể hình tròn hoặc đa giác để thay thế nhằm lấp đầy khoảng trống, cho đến khi tìm lại được chiếc đai ốc của mình.

Flabébé mất hoa
Flabébé có thể điều khiển và hấp thụ sức mạnh từ bông hoa của mình, nhưng sẽ cảm thấy không an toàn nếu không có nó. Khi tìm được một bông hoa ưng ý, nó sẽ gắn bó và chăm sóc bông hoa ấy suốt đời.

Mimikyu mất áo
Mimikyu thường ngụy trang bằng một tấm vải mang hình Pikachu, vì tin rằng hình dạng ấy dễ tạo thiện cảm. Khi mất đi tấm áo, Mimikyu sẽ hoảng loạn đi tìm vật thay thế, chỉ để tiếp tục che giấu hình hài mà nó luôn sợ người khác trông thấy.

Sewaddle rách lá
Khi thức ăn khan hiếm, Sewaddle sẽ ăn chiếc lá trên đầu như một giải pháp tạm thời để duy trì sự sống. Sau đó, nó sẽ tự làm quần áo mới bằng cách nhai lá và dùng tơ để khâu lại. Đôi khi, Leavanny sẽ giúp nó khâu và gắn những chiếc lá lên người một cách cẩn thận và đầy yêu thương.

Litwick tắt lửa
Khi ngọn lửa trên đầu Litwick cháy sáng, nó hút sinh lực của Pokemon hoặc con người xung quanh để làm nguyên liệu đốt cháy. Nếu ngọn lửa tắt, đồng nghĩa vớ việc nó không hút sinh lực.

Dwebble không vỏ
Khi tìm thấy tảng đá thích hợp làm vỏ, Dwebble sẽ phun ra chất ăn mòn từ miệng để tạo lỗ ở đáy, hoặc sửa chữa vỏ khi cần. Nếu tảng đá vỡ, Dwebble sẽ không yên tâm cho đến khi tìm được tảng đá thay thế.

Crustle không vỏ
Crustle chiến đấu với các thành viên trong loài để giành lãnh thổ, và những trận chiến có thể rất tàn khốc. Nếu mai của nó vỡ trong một trận chiến, nó sẽ thua và phải đi tìm một tảng đá mới để thay thế.

Dwebble vỏ cao
Trong cuộc chiến tranh giành lãnh thổ, những Dwebble thắng cuộc sẽ thu lấy vỏ đá của đối thủ và chồng lên vỏ đá cũ của mình bằng chất kết dính phun ra từ miệng để tăng thêm sức mạnh.
- Pokemon sơ sinh hoặc bị lão hóa.

Scyther già

Treecko già

Bellsprout già

Noctowl già

Hoothoot già

Stoutland già

Lugia sơ sinh

Vulpix sơ sinh

Mewtwo sơ sinh

Celeste sơ sinh

Miltank sơ sinh
- Các trường hợp hiếm gặp khác.

Porygon góc cạnh hóa
Porygon có thể thay đổi hình dạng cơ thể theo ý muốn bằng chiêu “Góc Cạnh Hóa” [Sharpen], từ đó tăng cường sức tấn công của mình.

Porygon biến tính
Một Porygon thay đổi tính chất cơ thể để giống với Weezing bằng chiêu “Biến Tính” [Conversion], từ đó thích ứng tốt hơn trong trận đấu.

Paras trồng nấm
Paras thường xuyên gỡ những cây nấm trên lưng để trồng ở những nơi ẩm ướt. Tuy nhiên, nó chỉ có thể gỡ luân phiên một trong hai cây nấm, nếu không sẽ rơi vào trạng thái hôn mê vô thời hạn.

Burmy rơi áo
Burmy che phủ cơ thể bằng áo choàng làm từ lá, cát hoặc rác thải, tùy vào môi trường mà nó sinh sống. Nếu áo choàng bị rơi, nó sẽ làm lại ngay lập tức. Khi tiến hóa thành Wormadam, áo choàng trở thành vĩnh viễn và không thể thay đổi.

Chân Hoothoot
Mặc dù Hoothoot có đủ cả hai chân, nhưng nó thường chỉ đứng bằng một chân và luân phiên giữa hai chân khi mỏi với tốc độ rất nhanh, khó có thể theo dõi bằng mắt thường.

Ursaring mắt nai
Sở dĩ Ursaring có đôi mắt ngây thơ của Teddiursa là do nó đang dùng chiêu “Làm Nũng” [Charm].

Smeargle đổi màu
Chất lỏng từ dịch tiết ở đuôi của Smeargle thay đổi màu sắc tùy theo cảm xúc của nó.

Sunflora rám nắng
Một Sunflora bị rám nắng da mặt do phơi nắng quá lâu dưới ánh Mặt Trời.

Togepi ngủ
Khi ngủ, Togepi có xu hướng thu mình trông như một quả trứng.

Sunflora ngủ
Khi ngủ, Sunflora có xu hướng khép cánh hoa lại trông như một nụ hoa.

Charizard đuôi lửa xanh
Ngọn lửa ở đuôi Charizard phản ánh sức khỏe và cảm xúc của nó. Khi tức giận, lửa chuyển sang màu trắng xanh, báo hiệu sức mạnh hủy diệt sắp bùng nổ.

Shellder của Slowking
Shellder có thể tách ra khỏi đầu của Slowking mà không gây hiện tượng thoái hóa như Slowbro, chỉ khiến Slowking tạm thời trở nên ngu ngốc. Do vết cắn của Shellder giải phóng nọc độc vào não Slowpoke, kích hoạt phản ứng hóa học giúp mở ra trí thông minh vượt trội và sức mạnh phi thường.

Deoxys chóp tam giác
Một Deoxys ngoài vũ trụ đang tồn tại dưới dạng hình chóp tam giác và di chuyển như một chiếc đĩa bay.

Sewaddle ngủ
Khi ngủ, Sewaddle có xu hướng cuộn người lại nhằm ẩn mình khỏi kẻ thù.

Magneton tách làm 3
Magneton có thể tách thành 3 bộ phận khi cần thiết. Tuy nhiên, chúng không phải là 3 cá thể Magnemite riêng biệt, vì vậy lý thuyết 3 Magnemite kết hợp thành 1 Magneton có thể chưa chính xác.

Vỏ Golem
Golem phát triển lớn hơn bằng cách lột da mỗi năm một lần. Lớp vỏ bị loại bỏ sẽ vỡ vụn và tan vào đất. Nông dân thường thu thập vỏ Golem để bón phân, giúp cây trồng phát triển.

Mặt nạ Yamask khóc
Vì từng là con người, Yamask vẫn giữ ký ức từ trước khi trở thành Pokemon. Đôi khi, nó nhìn vào chiếc mặt nạ và khóc, rõ ràng vì nhớ về những kỷ niệm đã qua. Nếu ai đó đeo chiếc mặt nạ của Yamask, họ sẽ bị chiếm hữu bởi linh hồn của nó.

Beartic chảy nước mũi
Trong một trường hợp hi hữu, Cubchoo tiến hóa thành Beartic nhưng vẫn giữ lại đặc điểm “chảy nước mũi” của mình.

Cơ thể Mimikyu
Mimikyu luôn ẩn mình dưới lớp vải hình Pikachu để giấu đi vẻ ngoài đáng sợ của mình. Bản vẽ concept của Mimikyu cũng cho thấy cơ thể của nó đen hoàn toàn.

Applin rơi táo
Trong bản game New Pokemon Snap, hình dáng thật của Applin ẩn bên trong quả táo được tiết lộ là một sinh vật giống như con rồng con, điều này hoàn toàn phù hợp với hệ Rồng mà Applin sở hữu.

Venusaur khép hoa
Venusaur sở hữu một chiến thuật đặc trưng, đó là dùng bông hoa trên lưng để giam giữ đối thủ, sau đó tung ra đòn “Chùm Tia Mặt Trời” [Solar Beam] để kết thúc trận chiến.

Oddish chôn mình
Oddish chôn cơ thể nhạy cảm của mình xuống đất vào ban ngày để tránh ánh nắng Mặt Trời và để đánh lừa những kẻ săn mồi.

Bulbasaur chôn mình
Bulbasaur chôn mình xuống đất, chỉ để lộ củ mầm, giúp hấp thụ ánh nắng Mặt Trời và đồng thời đánh lừa những kẻ săn mồi.

Ivysaur chôn mình
Ivysaur chôn mình xuống đất, chỉ để lộ nụ hoa, giúp hấp thụ ánh nắng Mặt Trời và đồng thời đánh lừa những kẻ săn mồi.